В рамках НИР в ФГБУ «ВГНКИ» создадут государственную коллекцию образцов кишечных микробиоценозов

Во Всероссийском государственном Центре качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов (ФГБУ «ВГНКИ») в рамках исполнения Федерального закона № 492-ФЗ «О биологической безопасности в Российской Федерации» выполняется НИР  по диагностике состояния нормальной микробиоты желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственной птицы под воздействием антимикробных и пробиотических препаратов с целью разработки мер, направленных на профилактику и борьбу с микробиом-ассоциированными болезнями птицы. Например, такими как сальмонеллез, колибактериоз, кампилобактериоз, клостридиоз и др.

Важнейшей функцией кишечной микрофлоры является ее участие в формировании резистентности организма к различным заболеваниям и обеспечение предотвращения колонизации желудочно-кишечного тракта посторонними микроорганизмами. В свою очередь, микробиота – совокупность сообществ микроорганизмов (симбиотических, условно-патогенных и (или) патогенных), населяющих конкретную среду обитания, тогда как микробиом – это совокупность генов микроорганизмов такого сообщества.

Несмотря на широкий спектр исследований в области изучения кишечного микробиома птицы, ряд вопросов до настоящего времени все еще остается нерешенным, среди них: различия таксономического состава микробиоценозов промышленной птицы и птицы свободного выгула, связь кишечного микробиома с медикаментозной нагрузкой и ряд других задач, связанных с питанием и содержанием птицы.

Использование комбинации комплексной метагеномики и традиционных микробиологических методов выделения и идентификации бактерий позволит оценить как филогенетическое разнообразие бактерий кишечного микробиома птицы на уровне типов, классов, семейств и родов, так и определить популяционный уровень доминирующих групп кишечных микроорганизмов и выделить чистые культуры, способные модулировать кишечную микробиоту.

Итогом НИР ФГБУ «ВГНКИ» станет детальная оценка нарушений микробиоты кишечника птицы при медикаментозной нагрузке антибиотиками, оценка возможности модуляции микробиомов с применением пробиотиков, создание государственных коллекций образцов кишечных микробиоценозов (биоматериалов) и консорциума доминирующих групп  кишечной микрофлоры птицы и чистых культур микроорганизмов с целью  использования  при разработке новых средств, биологических технологий, кормов и лекарственных препаратов для снижения риска развития инфекционных и неинфекционных болезней птицы.