В лабораториях ФГБУ «ВНИИКР» внедрен новый высокоточный метод диагностики

Сегодня в международной практике при лабораторном биологическом и фармацевтическом анализе активно применяется масс-спектрометрический метод – метод исследования и идентификации вещества, позволяющий определять концентрацию различных компонентов в нем. Он основывается на разделении ионов исследуемого вещества по величинам m/e (отношение массы иона m к его заряду e) и измерении этих величин. Его отличительной чертой служит возможность использования минимальной массы образца с обеспечением высокой достоверности результата. Этот аспект особенно важен при проведении фитосанитарных исследований с высоким уровнем требований к итоговому результату.

Впервые в Российской Федерации ученые подведомственного Россельхознадзору Всероссийского центра карантина растений (ФГБУ «ВНИИКР») апробировали и успешно внедрили данный метод исследований при проведении фитосанитарной диагностики.

Масс-спектрометрический метод анализа (далее MALDI-TOF) будет использован в качестве дополнительного способа экспресс-идентификации чистых бактериальных культур, полученных в ходе изоляции из растительных образцов.

Наряду с этим сотрудники лаборатории бактериологии и анализа ГМО ИЛЦ ФГБУ «ВНИИКР» начали уникальную работу по созданию доступной базы данных белковых профилей бактерий по карантинным и приоритетными экспортным видам бактерий. Апробирована процедура определения изолятов и штаммов бактерий методом MALDI-TOF. На данный момент в результате идентификации бактериальных изолятов специалистами уже обнаружены представители 25 различных родов.

Метод включен в ряд методических рекомендаций по выявлению и идентификации возбудителя бактериоза зерновых культур Pseudomonas syringae pv. coronafaciens, возбудителя черного бактериоза зерновых культур Xanthomonas translucens pv. translucens, возбудителя желтого слизистого бактериоза пшеницы Rathayibacter tritici, возбудителя стеблевого меланоза пшеницы Pseudomonas cichorii, в новую редакцию нормативного документа № 49-2019 МР ВНИИКР по выявлению и идентификации ржаво-бурой пятнистости сои Сurtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens.

В дальнейшем данный метод будет активно применяться при исследованиях экспортных партий грузов, что позволит получить отечественным сельхозтоваропроизводителям существенную поддержку в случае арбитражных споров.

Результаты по созданию баз данных и апробации процедуры определения изолятов и штаммов бактерий методом MALDI-TOF стали темами выступлений ученых ФГБУ «ВНИИКР» на международных конференциях и симпозиумах, где получили заслуженную оценку и признание научного сообщества.