О результатах научно-исследовательской работы отделения биотехнологии ФГБУ «ВГНКИ» за первое полугодие 2017 года

На прошедшей неделе на заседании Ученого совета ФГБУ
«Всероссийский государственный центр качества и стандартизации лекарственных
средств для животных и кормов» (ФГБУ «ВГНКИ») были подведены итоги
научно-исследовательской работы отделения биотехнологии за первое полугодие
2017 года.

В рамках проведения научно-исследовательской работы по теме
«Разработка универсальной методики видовой идентификации рыб методом
секвенирования фрагмента митохондриального генома для создания эффективной
системы идентификации новых рисков» был проведен анализ нуклеотидных
последовательностей геномов рыб из публичных баз данных (GenBank) и выбран
фрагмент гена 18S РНК в качестве мишени для видовой идентификации; также
выбраны и синтезированы универсальные вырожденные праймеры на участок гена 18S
РНК ядерного генома, позволяющие амплифицировать данные фрагменты генома
промысловых видов рыбы для видовой идентификации рыб в многокомпонентной
продукции.

Материалы исследований представлены в следующих публикациях:

1) Секвенирование фрагмента митохондриального генома
животных и рыб для определения видовой принадлежности мяса в однокомпонентной
продукции. Солтынская И.В., Прасолова О.В., Крылова Е.В., Ветошникова Б.Ю.,
Минайлова А.С., Плескачева М.А., Давыдова Е.Е. Тезисы Всероссийской
научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная
диагностика 2017», Молекулярная диагностика. Сб. Трудов/колл. авт., под ред.
В.И. Покровского — Т.2, стр. 434.

2) Секвенирование ДНК для определения видовой принадлежности
мяса. Солтынская И.В., Прасолова О. В., Ветошникова Б. Ю., Минайлова А. С.,
Плескачева М. А., Давыдова Е. Е. Ветеринария, 2017, принято в печать.

Научно-исследовательская работа по теме «Разработка методик
для выявления и идентификации целевых генов и новых регуляторных
последовательностей генно-инженерно-модифицированных организмов» в течение
первого полугодия 2017 года проводилась по следующим направлениям:

изучение генетических особенностей различных трансгенных
конструкций ГМ-растений, выявление наиболее перспективных для скрининговых
исследований мишеней;

подбор и синтезирование праймеров и зондов для выявления
целевых генов и регуляторных элементов bar, nptII, p_Rice_actine и др.;

разработка контрольных образцов ПКО на основе плазмидных
препаратов;

оптимизация условий ПЦР с детекцией в режиме «реального
времени» с определением чувствительности и специфичности методик;

подобор и синтезирование праймеров и зондов для выявления
ГМ-линии риса LL62. Оптимизация условия ПЦР. Определение чувствительности и
специфичности методики;

запланирован подбор и синтез праймеров и зондов для
выявления ГМ-картофеля ЕН92-527-1, оптимизация условий ПЦР, определение
чувствительности и специфичности методики;

запланирована разработка плазмидных калибраторов для методик
количественного определения. Метрологическая экспертиза методик количественного
определения, аттестация методик.

В рамках научно-исследовательской деятельности по теме
«Разработка современных требований и правил мониторинга качества спермы
быков-производителей по эпизоотическим, генетическим и репродуктивным
параметрам» сотрудниками отделения биотехнологии

предложен ускоренный метод окраски сперматозоидов с
аномальной морфологией при помощи красителя Farelly, оптимизированы условия
идентификации видов патологических форм сперматозоидов;

при исследовании проб спермы от 20 быков-производителей,
разделенной по полу, показано, что средний показатель количества сперматозоидов
с интактной акросомой составил у 19 быков 74%, у одного — менее 50%; выявлено 4
быка с индексом фрагментации ДНК в головке сперматозоида более 30% и 6 быков с
митохондриальной дисфункцией; во всех исследованных пробах спермы число
сперматозоидов с прямолинейно-поступательным движением составляло менее 40%,
что не соответствует ГОСТ;

проведено исследование 213 образцов спермы на наличие 13
различных возбудителей с использованием ПЦР-наборов с разными форматами
детекции; в образцах спермы была выявлена ДНК микроорганизмов рода
Campylobacter и Mycoplasma (по 78%), Histophilus sommi (84%), вируса BHV 1 и 4
типа (по 1%);

разработаны методики идентификации мутаций, ассоциированных
с наиболее распространеннысми наследственными патологиями КРС бурой швицкой
породы.

Материалы исследований прошли апробацию на двух
конференциях: «Молекулярная диагностика 2017», Москва; «Перспективы и
актуальные проблемы развития высокопродуктивного молочного и мясного
скотоводства», Витебск.